W Chorwacji istnieje osiem Parków Narodowych. Są to obszary objęte ścisłą ochroną państwa. Parki Narodowe Chorwacji to archipelag Brijuni, góra Risnjak, północny Velebit, jeziora Plitvice, Paklenica, wyspy Kornati, wodospady Krka oraz wyspa Mljet. Trzy z nich są morskimi Parkami Narodowymi, a pozostałe (z wyjątkiem jezior Plitvice) są położone w pobliżu wybrzeża.
Archipelag ten składa się z 14 wysp i wysepek. Są one położone w pobliżu Puli, wzdłuż zachodniego wybrzeża Istrii. Zajmują one 7,42 kilometrów kwadratowych powierzchni i obfitują w bogactwo nienaruszonej fauny i flory oraz cenne pozostałości cywilizacji rzymskiej i bizantyjskiej.
Obszar chroniony obejmuje nie tylko same wyspy, ale również otaczające je morze. Został on ustanowiony, aby chronić bujną śródziemnomorska roślinność, liczne endemiczne i rzadkie gatunki roślin i zwierząt oraz dziewiczą przyrodę. Na dwóch największych wyspach, Veliki i Mali Brijun, znajduje się park safari i park etniczny, rezerwat ptaków, wiele importowanych gatunków roślin, antyczne gaje oliwne, parki, lasy, muzea, fortece i wille.
Przez wieki wyspy były ulubionym miejscem podróży urzędników państwowych i arystokracji, a w ciągu ostatnich kilku lat stały się popularne wśród żeglarzy oraz innych entuzjastów sportów wodnych.
Archipelag ten składa się z około 140 niezamieszkałych wysp, wysepek i raf i zajmuje jedynie 70 kilometrów kwadratowych powierzchni, z czego 3 to woda. Największa część archipelagu (89 wysp, 220 m²) stanowi Park Narodowy.
Wyspy Kornati położone są w Dalmacji północnej i rozciągają się wzdłuż wybrzeża pomiędzy miastami Sibenik i Zadar. Wyspy te są charakterystyczne ze względu na ich niezwykłe kształty, tak zwane “korony”, oraz inne nietypowe formy geologiczne.
Jest to najbardziej poszarpana grupa wysp na Morzu Śródziemnym i słynny raj dla żeglarzy. Żeglowanie wśród tych wysp jest wyzwaniem dla każdego żeglarza i jedynym w swoim rodzaju, niezapomnianym doświadczeniem.
Mljet to wyspa na południowym Adriatyku, niedaleko Dubrownika. Słynie z obfitej i różnorodnej śródziemnomorskiej roślinności, endemicznych gatunków roślin, dziedzictwa historii z czasów Ilirii, zachwycających krajobrazów, poszarpanego wybrzeża, jaskiń, grot, klasztorów, kościołów i szczególnego piękna. Mljet słynie również ze swoich dwóch słonych jezior, które mają po 10 tysięcy lat i których wody były niegdyś słodkie, co jest geologicznym i oceanograficznym fenomenem. Jeziora te są w gruncie rzeczy zatokami, ale kanał łączący je z morzem jest tak wąski, że są one uznawane za jeziora.
Południowa część wyspy w 1960 roku została uznana za Park Narodowy. Była to pierwsza w historii próba ochrony ekosystemu na Adriatyku.
Rezerwat przyrody to drugi pod względem ważności obszar chroniony. W Chorwacji znajduje się 11 rezerwatów przyrody i jedynie dwa spośród nich są rezerwatami morskimi – zatoka Telascica i archipelag Lastovo.
Telascica to duża zatoka na południowo-wschodnim wybrzeżu wyspy Dugi Otok. Wewnątrz zatoki znajduje się największa, najbezpieczniejsza i według wielu, najpiękniejsza laguna na Adriatyku, a także geomorfologiczny fenomen – jezioro Mir, wysokie klify i tysiące gatunków roślin i zwierząt.
Telascica otoczona jest przez duże i małe wysepki, a wewnątrz samej zatoki znajduje się sześć wysepek. Wybrzeże ma długość 69 km i obejmuje 25 mniejszych zatoczek. Obszar zatoki stanowi rezerwat przyrody, ze względu na bogatą faunę i florę, ponad 550 gatunków morskich, charakterystyczną geologię oraz dziedzictwo archeologiczne.
To najmłodszy rezerwat przyrody w Chorwacji. Został założony w październiku 2006, składa się z 44 wysp i obejmuje powierzchnię prawie 96 km², z których jedynie jeden to stały ląd.
Archipelag ten leży w Dalmacji południowej niedaleko wyspy Korcula.
Największe wyspy archipelagu to Lastovo i Susac. Lastovo to druga pod względem zalesienia wyspa na Adriatyku (po Mljet) a Susac jest właściwie niezamieszkały. Archipelag ten jest jednym z najlepiej zachowanych obszarów morskich na Adriatyku i jest nienaruszony ekologicznie.
George Bernard Shaw pisał o nim:
Pośród łańcucha srebrnych wysp, nad Morzem Adriatyckim, wznosi się zalesione Lastovo, niesamowicie piękna wyspa, która z zewnątrz przypomina zapomnianego towarzysza historii, podczas gdy tam, w cieniu wysokich drzew oliwnych, życie kwitnie od czasów przedhelleńskich.